La collection audiovisuelle compte plus de 6000 CD et 6000 DVD. Elle s’enrichit chaque année de nouvelles éditions CD et DVD ainsi que de documents numériques en ligne.
Cette collection se compose aussi de documents inédits issus de la recherche et de collectes de terrain, ainsi que de captations des spectacles, concerts et conférences du musée. La collection discographique comprend des musiques de tradition orale et des musiques populaires issues des 5 continents. La collection filmique rassemble des documentaires spécialisés dans le domaine de l’anthropologie visuelle ainsi que des arts et civilisations non occidentales.
Les documents numériques de la collection audiovisuelle représentent plus de 2 100 titres : captations des concerts, spectacles, conférences et colloques du musée, ainsi que des films et des enregistrements sonores inédits : fonds Gilbert Rouget, Francis Corpataux, Geneviève Dournon, Charles Duvelle, Laurent Jeanneau, Pierre Amado, Jacqueline Roumeguère-Eberhardt etc.
Les documents inédits les plus anciens sont constitués de supports analogiques originaux (bandes magnétiques, bobines films 8 et 16 mm etc.). Ces archives audiovisuelles numérisées sont issues de dons ou des anciennes collections du musée national des Arts d’Afrique et d’Océanie (Fonds Pierre Harter, Bohumil Holas, Philip Dark, Kalman Muller, Hélène Pennec, etc.) ou du musée de l’Homme (Fonds Henri Lehmann).
La médiathèque donne également accès à des bases de données d'archives sonores et de films en ligne, tels que la plateforme Télémeta des Archives sonores CNRS-Musée de l’Homme, le portail Med-Mem de l’INA (Mémoires audiovisuelles de la Méditerranée) et Ethnographic Video Online, représentant 1750 heures de films (DER, RAI, BBC, Film Australia Collection etc.).